Documentation of MULTICOM

MULTICOM is a Protein Tertiary Structure Predictor Using Multi-Template Combination.

MULTICOM was ranked among the best protein tertiary structure predictors during the 8th and 9th Critical Assessments of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP8,9) in 2008 and 2010, respectively.

-----------------------------------------------------------------------------------------
There is an example for Protein Tertiary Structure Prediction using MULTICOM.

Input sequence:

MNLRWTSEAKTKLKNIPFFARSQAKARIEQLARQAEQDIVTPELVEQARLEFGQ

Prediction results:

Protein template structures (PDB code + chain id) used to generate the model and the e-values of their alignments with the target (smaller, more significant):
2KRUA 2.1e-28
2L09A 1.2e-23

PFRMAT TS
TARGET query
AUTHOR MULTICOM
METHOD Z. Wang, J. Eickholt and J. Cheng. MULTICOM: a multi-level combination
METHOD approach to protein structure prediction and its assessment in CASP8.
METHOD Bioinformatics. 26(7):882-888, 2010.
MODEL 1
PDB TEMPLATE PARENT 2KRUA 2L09A

ATOM      1  N   MET     1       8.270 -12.198   0.663  1.00 81.71       1SG   2
ATOM      2  CA  MET     1       8.403 -10.771   1.037  1.00 81.71       1SG   3
ATOM      3  CB  MET     1       9.815 -10.263   0.720  1.00 81.71       1SG   4
ATOM      4  CG  MET     1      10.901 -10.971   1.530  1.00 81.71       1SG   5
ATOM      5  SD  MET     1      10.775 -10.723   3.327  1.00 81.71       1SG   6
ATOM      6  CE  MET     1       9.415 -11.901   3.573  1.00 81.71       1SG   7
ATOM      7  C   MET     1       7.411  -9.953   0.280  1.00 81.71       1SG   8
ATOM      8  O   MET     1       6.475  -9.411   0.864  1.00 81.71       1SG   9
ATOM      9  N   ASN     2       7.590  -9.841  -1.051  1.00 57.13       1SG  10
ATOM     10  CA  ASN     2       6.662  -9.067  -1.819  1.00 57.13       1SG  11
ATOM     11  CB  ASN     2       7.267  -8.427  -3.080  1.00 57.13       1SG  12
ATOM     12  CG  ASN     2       7.727  -9.548  -3.998  1.00 57.13       1SG  13
ATOM     13  OD1 ASN     2       6.948 -10.114  -4.764  1.00 57.13       1SG  14
ATOM     14  ND2 ASN     2       9.043  -9.877  -3.922  1.00 57.13       1SG  15
ATOM     15  C   ASN     2       5.548  -9.966  -2.250  1.00 57.13       1SG  16
ATOM     16  O   ASN     2       5.727 -11.170  -2.421  1.00 57.13       1SG  17
ATOM     17  N   LEU     3       4.342  -9.389  -2.394  1.00103.48       1SG  18
ATOM     18  CA  LEU     3       3.196 -10.139  -2.816  1.00103.48       1SG  19
ATOM     19  CB  LEU     3       1.847  -9.555  -2.344  1.00103.48       1SG  20
ATOM     20  CG  LEU     3       1.619  -9.638  -0.818  1.00103.48       1SG  21
ATOM     21  CD1 LEU     3       2.594  -8.748  -0.032  1.00103.48       1SG  22
ATOM     22  CD2 LEU     3       0.149  -9.369  -0.462  1.00103.48       1SG  23
ATOM     23  C   LEU     3       3.183 -10.166  -4.308  1.00103.48       1SG  24
ATOM     24  O   LEU     3       3.974  -9.489  -4.962  1.00103.48       1SG  25
ATOM     25  N   ARG     4       2.293 -11.000  -4.883  1.00115.69       1SG  26
ATOM     26  CA  ARG     4       2.209 -11.089  -6.309  1.00115.69       1SG  27
ATOM     27  CB  ARG     4       1.456 -12.330  -6.808  1.00115.69       1SG  28
ATOM     28  CG  ARG     4       2.150 -13.653  -6.503  1.00115.69       1SG  29
ATOM     29  CD  ARG     4       1.521 -14.816  -7.267  1.00115.69       1SG  30
ATOM     30  NE  ARG     4       1.709 -14.526  -8.716  1.00115.69       1SG  31
ATOM     31  CZ  ARG     4       1.302 -15.427  -9.658  1.00115.69       1SG  32
ATOM     32  NH1 ARG     4       0.704 -16.591  -9.272  1.00115.69       1SG  33
ATOM     33  NH2 ARG     4       1.493 -15.163 -10.983  1.00115.69       1SG  34
ATOM     34  C   ARG     4       1.449  -9.904  -6.807  1.00115.69       1SG  35
ATOM     35  O   ARG     4       0.365  -9.587  -6.320  1.00115.69       1SG  36
ATOM     36  N   TRP     5       2.004  -9.222  -7.822  1.00 74.37       1SG  37
ATOM     37  CA  TRP     5       1.347  -8.076  -8.371  1.00 74.37       1SG  38
ATOM     38  CB  TRP     5       2.281  -6.866  -8.542  1.00 74.37       1SG  39
ATOM     39  CG  TRP     5       2.658  -6.190  -7.250  1.00 74.37       1SG  40
ATOM     40  CD2 TRP     5       2.194  -4.883  -6.870  1.00 74.37       1SG  41
ATOM     41  CD1 TRP     5       3.480  -6.616  -6.248  1.00 74.37       1SG  42
ATOM     42  NE1 TRP     5       3.546  -5.662  -5.262  1.00 74.37       1SG  43
ATOM     43  CE2 TRP     5       2.764  -4.589  -5.634  1.00 74.37       1SG  44
ATOM     44  CE3 TRP     5       1.365  -4.004  -7.503  1.00 74.37       1SG  45
ATOM     45  CZ2 TRP     5       2.513  -3.401  -5.008  1.00 74.37       1SG  46
ATOM     46  CZ3 TRP     5       1.114  -2.808  -6.869  1.00 74.37       1SG  47
ATOM     47  CH2 TRP     5       1.676  -2.513  -5.645  1.00 74.37       1SG  48
ATOM     48  C   TRP     5       0.846  -8.448  -9.726  1.00 74.37       1SG  49
ATOM     49  O   TRP     5       1.568  -9.032 -10.533  1.00 74.37       1SG  50
ATOM     50  N   THR     6      -0.428  -8.111 -10.001  1.00 41.19       1SG  51
ATOM     51  CA  THR     6      -1.024  -8.405 -11.269  1.00 41.19       1SG  52
ATOM     52  CB  THR     6      -2.522  -8.439 -11.216  1.00 41.19       1SG  53
ATOM     53  OG1 THR     6      -3.021  -7.200 -10.736  1.00 41.19       1SG  54
ATOM     54  CG2 THR     6      -2.955  -9.585 -10.286  1.00 41.19       1SG  55
ATOM     55  C   THR     6      -0.595  -7.352 -12.241  1.00 41.19       1SG  56
ATOM     56  O   THR     6      -0.089  -6.298 -11.860  1.00 41.19       1SG  57
ATOM     57  N   SER     7      -0.784  -7.630 -13.544  1.00 27.55       1SG  58
ATOM     58  CA  SER     7      -0.347  -6.728 -14.569  1.00 27.55       1SG  59
ATOM     59  CB  SER     7      -0.626  -7.264 -15.982  1.00 27.55       1SG  60
ATOM     60  OG  SER     7       0.114  -8.456 -16.199  1.00 27.55       1SG  61
ATOM     61  C   SER     7      -1.078  -5.435 -14.419  1.00 27.55       1SG  62
ATOM     62  O   SER     7      -0.504  -4.362 -14.595  1.00 27.55       1SG  63
ATOM     63  N   GLU     8      -2.380  -5.507 -14.094  1.00115.66       1SG  64
ATOM     64  CA  GLU     8      -3.151  -4.313 -13.932  1.00115.66       1SG  65
ATOM     65  CB  GLU     8      -4.669  -4.570 -13.820  1.00115.66       1SG  66
ATOM     66  CG  GLU     8      -5.082  -5.675 -12.845  1.00115.66       1SG  67
ATOM     67  CD  GLU     8      -5.233  -6.969 -13.638  1.00115.66       1SG  68
ATOM     68  OE1 GLU     8      -4.789  -6.991 -14.816  1.00115.66       1SG  69
ATOM     69  OE2 GLU     8      -5.799  -7.946 -13.077  1.00115.66       1SG  70
ATOM     70  C   GLU     8      -2.659  -3.555 -12.737  1.00115.66       1SG  71
ATOM     71  O   GLU     8      -2.592  -2.327 -12.768  1.00115.66       1SG  72
ATOM     72  N   ALA     9      -2.290  -4.268 -11.655  1.00 32.12       1SG  73
ATOM     73  CA  ALA     9      -1.821  -3.631 -10.456  1.00 32.12       1SG  74
ATOM     74  CB  ALA     9      -1.507  -4.634  -9.332  1.00 32.12       1SG  75
ATOM     75  C   ALA     9      -0.557  -2.890 -10.759  1.00 32.12       1SG  76
ATOM     76  O   ALA     9      -0.349  -1.775 -10.282  1.00 32.12       1SG  77
ATOM     77  N   LYS    10       0.321  -3.492 -11.579  1.00109.02       1SG  78
ATOM     78  CA  LYS    10       1.573  -2.870 -11.899  1.00109.02       1SG  79
ATOM     79  CB  LYS    10       2.401  -3.681 -12.908  1.00109.02       1SG  80
ATOM     80  CG  LYS    10       2.945  -4.989 -12.337  1.00109.02       1SG  81
ATOM     81  CD  LYS    10       3.936  -4.782 -11.190  1.00109.02       1SG  82
ATOM     82  CE  LYS    10       4.442  -6.091 -10.578  1.00109.02       1SG  83
ATOM     83  NZ  LYS    10       5.151  -6.892 -11.601  1.00109.02       1SG  84
ATOM     84  C   LYS    10       1.292  -1.559 -12.559  1.00109.02       1SG  85
ATOM     85  O   LYS    10       1.935  -0.553 -12.260  1.00109.02       1SG  86
ATOM     86  N   THR    11       0.309  -1.537 -13.477  1.00 23.72       1SG  87
ATOM     87  CA  THR    11       0.000  -0.335 -14.197  1.00 23.72       1SG  88
ATOM     88  CB  THR    11      -1.120  -0.518 -15.179  1.00 23.72       1SG  89
ATOM     89  OG1 THR    11      -0.799  -1.535 -16.116  1.00 23.72       1SG  90
ATOM     90  CG2 THR    11      -1.356   0.814 -15.911  1.00 23.72       1SG  91
ATOM     91  C   THR    11      -0.455   0.694 -13.215  1.00 23.72       1SG  92
ATOM     92  O   THR    11      -0.068   1.859 -13.297  1.00 23.72       1SG  93
ATOM     93  N   LYS    12      -1.293   0.275 -12.250  1.00 90.89       1SG  94
ATOM     94  CA  LYS    12      -1.833   1.180 -11.278  1.00 90.89       1SG  95
ATOM     95  CB  LYS    12      -2.806   0.505 -10.295  1.00 90.89       1SG  96
ATOM     96  CG  LYS    12      -4.090  -0.010 -10.946  1.00 90.89       1SG  97
ATOM     97  CD  LYS    12      -4.922   1.083 -11.619  1.00 90.89       1SG  98
ATOM     98  CE  LYS    12      -6.219   0.561 -12.239  1.00 90.89       1SG  99
ATOM     99  NZ  LYS    12      -6.980   1.677 -12.843  1.00 90.89       1SG 100
ATOM    100  C   LYS    12      -0.721   1.748 -10.450  1.00 90.89       1SG 101
ATOM    101  O   LYS    12      -0.722   2.935 -10.133  1.00 90.89       1SG 102
ATOM    102  N   LEU    13       0.263   0.910 -10.074  1.00 53.34       1SG 103
ATOM    103  CA  LEU    13       1.346   1.342  -9.234  1.00 53.34       1SG 104
ATOM    104  CB  LEU    13       2.319   0.204  -8.882  1.00 53.34       1SG 105
ATOM    105  CG  LEU    13       3.496   0.638  -7.984  1.00 53.34       1SG 106
ATOM    106  CD1 LEU    13       3.018   1.144  -6.615  1.00 53.34       1SG 107
ATOM    107  CD2 LEU    13       4.543  -0.484  -7.868  1.00 53.34       1SG 108
ATOM    108  C   LEU    13       2.132   2.400  -9.940  1.00 53.34       1SG 109
ATOM    109  O   LEU    13       2.569   3.370  -9.327  1.00 53.34       1SG 110
ATOM    110  N   LYS    14       2.341   2.247 -11.261  1.00 95.57       1SG 111
ATOM    111  CA  LYS    14       3.123   3.219 -11.965  1.00 95.57       1SG 112
ATOM    112  CB  LYS    14       3.476   2.837 -13.418  1.00 95.57       1SG 113
ATOM    113  CG  LYS    14       2.325   2.825 -14.423  1.00 95.57       1SG 114
ATOM    114  CD  LYS    14       2.852   2.788 -15.862  1.00 95.57       1SG 115
ATOM    115  CE  LYS    14       1.769   2.763 -16.940  1.00 95.57       1SG 116
ATOM    116  NZ  LYS    14       2.391   2.860 -18.282  1.00 95.57       1SG 117
ATOM    117  C   LYS    14       2.412   4.537 -11.950  1.00 95.57       1SG 118
ATOM    118  O   LYS    14       3.046   5.590 -12.000  1.00 95.57       1SG 119
ATOM    119  N   ASN    15       1.069   4.508 -11.896  1.00 53.90       1SG 120
ATOM    120  CA  ASN    15       0.260   5.693 -11.909  1.00 53.90       1SG 121
ATOM    121  CB  ASN    15      -1.244   5.377 -11.956  1.00 53.90       1SG 122
ATOM    122  CG  ASN    15      -1.539   4.822 -13.343  1.00 53.90       1SG 123
ATOM    123  OD1 ASN    15      -0.874   5.183 -14.313  1.00 53.90       1SG 124
ATOM    124  ND2 ASN    15      -2.559   3.928 -13.447  1.00 53.90       1SG 125
ATOM    125  C   ASN    15       0.530   6.525 -10.685  1.00 53.90       1SG 126
ATOM    126  O   ASN    15       0.455   7.750 -10.752  1.00 53.90       1SG 127
ATOM    127  N   ILE    16       0.826   5.902  -9.525  1.00150.81       1SG 128
ATOM    128  CA  ILE    16       1.074   6.662  -8.325  1.00150.81       1SG 129
ATOM    129  CB  ILE    16       1.064   5.883  -7.037  1.00150.81       1SG 130
ATOM    130  CG2 ILE    16      -0.359   5.385  -6.784  1.00150.81       1SG 131
ATOM    131  CG1 ILE    16       2.128   4.783  -7.026  1.00150.81       1SG 132
ATOM    132  CD1 ILE    16       2.227   4.064  -5.683  1.00150.81       1SG 133
ATOM    133  C   ILE    16       2.388   7.371  -8.410  1.00150.81       1SG 134
ATOM    134  O   ILE    16       3.313   6.951  -9.104  1.00150.81       1SG 135
ATOM    135  N   PRO    17       2.456   8.480  -7.717  1.00 77.41       1SG 136
ATOM    136  CA  PRO    17       3.644   9.287  -7.712  1.00 77.41       1SG 137
ATOM    137  CD  PRO    17       1.267   9.246  -7.378  1.00 77.41       1SG 138
ATOM    138  CB  PRO    17       3.274  10.561  -6.961  1.00 77.41       1SG 139
ATOM    139  CG  PRO    17       1.758  10.693  -7.202  1.00 77.41       1SG 140
ATOM    140  C   PRO    17       4.777   8.521  -7.112  1.00 77.41       1SG 141
ATOM    141  O   PRO    17       4.550   7.723  -6.205  1.00 77.41       1SG 142
ATOM    142  N   PHE    18       6.004   8.773  -7.600  1.00 51.53       1SG 143
ATOM    143  CA  PHE    18       7.166   8.025  -7.222  1.00 51.53       1SG 144
ATOM    144  CB  PHE    18       8.422   8.439  -7.999  1.00 51.53       1SG 145
ATOM    145  CG  PHE    18       9.521   7.568  -7.502  1.00 51.53       1SG 146
ATOM    146  CD1 PHE    18       9.695   6.307  -8.023  1.00 51.53       1SG 147
ATOM    147  CD2 PHE    18      10.370   8.005  -6.511  1.00 51.53       1SG 148
ATOM    148  CE1 PHE    18      10.705   5.494  -7.570  1.00 51.53       1SG 149
ATOM    149  CE2 PHE    18      11.382   7.194  -6.053  1.00 51.53       1SG 150
ATOM    150  CZ  PHE    18      11.551   5.939  -6.582  1.00 51.53       1SG 151
ATOM    151  C   PHE    18       7.469   8.181  -5.770  1.00 51.53       1SG 152
ATOM    152  O   PHE    18       7.850   7.218  -5.107  1.00 51.53       1SG 153
ATOM    153  N   PHE    19       7.326   9.401  -5.228  1.00 60.48       1SG 154
ATOM    154  CA  PHE    19       7.693   9.603  -3.857  1.00 60.48       1SG 155
ATOM    155  CB  PHE    19       7.377  11.024  -3.363  1.00 60.48       1SG 156
ATOM    156  CG  PHE    19       8.135  11.982  -4.212  1.00 60.48       1SG 157
ATOM    157  CD1 PHE    19       9.476  12.200  -4.000  1.00 60.48       1SG 158
ATOM    158  CD2 PHE    19       7.495  12.666  -5.220  1.00 60.48       1SG 159
ATOM    159  CE1 PHE    19      10.173  13.087  -4.785  1.00 60.48       1SG 160
ATOM    160  CE2 PHE    19       8.184  13.554  -6.009  1.00 60.48       1SG 161
ATOM    161  CZ  PHE    19       9.524  13.763  -5.791  1.00 60.48       1SG 162
ATOM    162  C   PHE    19       6.867   8.687  -3.008  1.00 60.48       1SG 163
ATOM    163  O   PHE    19       7.393   7.994  -2.140  1.00 60.48       1SG 164
ATOM    164  N   ALA    20       5.543   8.716  -3.249  1.00 74.45       1SG 165
ATOM    165  CA  ALA    20       4.480   8.004  -2.589  1.00 74.45       1SG 166
ATOM    166  CB  ALA    20       3.081   8.541  -2.943  1.00 74.45       1SG 167
ATOM    167  C   ALA    20       4.464   6.528  -2.867  1.00 74.45       1SG 168
ATOM    168  O   ALA    20       3.897   5.769  -2.086  1.00 74.45       1SG 169
ATOM    169  N   ARG    21       5.004   6.078  -4.014  1.00192.17       1SG 170
ATOM    170  CA  ARG    21       4.811   4.709  -4.410  1.00192.17       1SG 171
ATOM    171  CB  ARG    21       5.326   4.391  -5.824  1.00192.17       1SG 172
ATOM    172  CG  ARG    21       6.804   4.670  -6.056  1.00192.17       1SG 173
ATOM    173  CD  ARG    21       7.155   4.735  -7.543  1.00192.17       1SG 174
ATOM    174  NE  ARG    21       6.942   3.383  -8.132  1.00192.17       1SG 175
ATOM    175  CZ  ARG    21       6.437   3.269  -9.395  1.00192.17       1SG 176
ATOM    176  NH1 ARG    21       6.063   4.388 -10.079  1.00192.17       1SG 177
ATOM    177  NH2 ARG    21       6.298   2.041  -9.974  1.00192.17       1SG 178
ATOM    178  C   ARG    21       5.323   3.711  -3.413  1.00192.17       1SG 179
ATOM    179  O   ARG    21       4.667   2.694  -3.191  1.00192.17       1SG 180
ATOM    180  N   SER    22       6.485   3.936  -2.776  1.00 28.08       1SG 181
ATOM    181  CA  SER    22       6.929   2.968  -1.812  1.00 28.08       1SG 182
ATOM    182  CB  SER    22       8.280   3.336  -1.176  1.00 28.08       1SG 183
ATOM    183  OG  SER    22       8.661   2.342  -0.236  1.00 28.08       1SG 184
ATOM    184  C   SER    22       5.911   2.923  -0.716  1.00 28.08       1SG 185
ATOM    185  O   SER    22       5.585   1.855  -0.196  1.00 28.08       1SG 186
ATOM    186  N   GLN    23       5.373   4.102  -0.349  1.00 39.96       1SG 187
ATOM    187  CA  GLN    23       4.398   4.202   0.699  1.00 39.96       1SG 188
ATOM    188  CB  GLN    23       3.951   5.653   0.946  1.00 39.96       1SG 189
ATOM    189  CG  GLN    23       2.888   5.782   2.038  1.00 39.96       1SG 190
ATOM    190  CD  GLN    23       3.537   5.460   3.373  1.00 39.96       1SG 191
ATOM    191  OE1 GLN    23       4.344   6.234   3.886  1.00 39.96       1SG 192
ATOM    192  NE2 GLN    23       3.181   4.284   3.954  1.00 39.96       1SG 193
ATOM    193  C   GLN    23       3.174   3.438   0.301  1.00 39.96       1SG 194
ATOM    194  O   GLN    23       2.633   2.668   1.091  1.00 39.96       1SG 195
ATOM    195  N   ALA    24       2.711   3.627  -0.948  1.00 35.95       1SG 196
ATOM    196  CA  ALA    24       1.513   2.994  -1.421  1.00 35.95       1SG 197
ATOM    197  CB  ALA    24       1.113   3.462  -2.831  1.00 35.95       1SG 198
ATOM    198  C   ALA    24       1.700   1.509  -1.474  1.00 35.95       1SG 199
ATOM    199  O   ALA    24       0.820   0.748  -1.077  1.00 35.95       1SG 200
ATOM    200  N   LYS    25       2.875   1.055  -1.940  1.00127.72       1SG 201
ATOM    201  CA  LYS    25       3.119  -0.346  -2.111  1.00127.72       1SG 202
ATOM    202  CB  LYS    25       4.531  -0.611  -2.658  1.00127.72       1SG 203
ATOM    203  CG  LYS    25       4.767  -2.040  -3.131  1.00127.72       1SG 204
ATOM    204  CD  LYS    25       4.671  -3.093  -2.037  1.00127.72       1SG 205
ATOM    205  CE  LYS    25       4.982  -4.491  -2.566  1.00127.72       1SG 206
ATOM    206  NZ  LYS    25       6.424  -4.771  -2.445  1.00127.72       1SG 207
ATOM    207  C   LYS    25       2.973  -1.022  -0.783  1.00127.72       1SG 208
ATOM    208  O   LYS    25       2.396  -2.105  -0.690  1.00127.72       1SG 209
ATOM    209  N   ALA    26       3.480  -0.389   0.289  1.00 27.28       1SG 210
ATOM    210  CA  ALA    26       3.390  -0.980   1.591  1.00 27.28       1SG 211
ATOM    211  CB  ALA    26       4.066  -0.130   2.679  1.00 27.28       1SG 212
ATOM    212  C   ALA    26       1.944  -1.111   1.955  1.00 27.28       1SG 213
ATOM    213  O   ALA    26       1.526  -2.123   2.514  1.00 27.28       1SG 214
ATOM    214  N   ARG    27       1.143  -0.076   1.645  1.00 87.55       1SG 215
ATOM    215  CA  ARG    27      -0.250  -0.055   1.992  1.00 87.55       1SG 216
ATOM    216  CB  ARG    27      -0.906   1.291   1.636  1.00 87.55       1SG 217
ATOM    217  CG  ARG    27      -0.195   2.498   2.257  1.00 87.55       1SG 218
ATOM    218  CD  ARG    27      -0.260   2.545   3.783  1.00 87.55       1SG 219
ATOM    219  NE  ARG    27      -1.692   2.710   4.151  1.00 87.55       1SG 220
ATOM    220  CZ  ARG    27      -2.054   3.654   5.067  1.00 87.55       1SG 221
ATOM    221  NH1 ARG    27      -1.100   4.440   5.646  1.00 87.55       1SG 222
ATOM    222  NH2 ARG    27      -3.370   3.821   5.387  1.00 87.55       1SG 223
ATOM    223  C   ARG    27      -0.984  -1.130   1.242  1.00 87.55       1SG 224
ATOM    224  O   ARG    27      -1.786  -1.867   1.816  1.00 87.55       1SG 225
ATOM    225  N   ILE    28      -0.702  -1.258  -0.068  1.00 41.35       1SG 226
ATOM    226  CA  ILE    28      -1.406  -2.176  -0.922  1.00 41.35       1SG 227
ATOM    227  CB  ILE    28      -0.932  -2.096  -2.346  1.00 41.35       1SG 228
ATOM    228  CG2 ILE    28      -1.613  -3.220  -3.146  1.00 41.35       1SG 229
ATOM    229  CG1 ILE    28      -1.175  -0.685  -2.913  1.00 41.35       1SG 230
ATOM    230  CD1 ILE    28      -0.446  -0.420  -4.231  1.00 41.35       1SG 231
ATOM    231  C   ILE    28      -1.168  -3.577  -0.454  1.00 41.35       1SG 232
ATOM    232  O   ILE    28      -2.092  -4.385  -0.370  1.00 41.35       1SG 233
ATOM    233  N   GLU    29       0.092  -3.900  -0.128  1.00107.62       1SG 234
ATOM    234  CA  GLU    29       0.455  -5.225   0.279  1.00107.62       1SG 235
ATOM    235  CB  GLU    29       1.954  -5.359   0.563  1.00107.62       1SG 236
ATOM    236  CG  GLU    29       2.831  -4.935  -0.609  1.00107.62       1SG 237
ATOM    237  CD  GLU    29       2.354  -5.633  -1.875  1.00107.62       1SG 238
ATOM    238  OE1 GLU    29       1.233  -5.309  -2.350  1.00107.62       1SG 239
ATOM    239  OE2 GLU    29       3.114  -6.495  -2.389  1.00107.62       1SG 240
ATOM    240  C   GLU    29      -0.230  -5.534   1.570  1.00107.62       1SG 241
ATOM    241  O   GLU    29      -0.636  -6.670   1.810  1.00107.62       1SG 242
ATOM    242  N   GLN    30      -0.335  -4.522   2.454  1.00 82.61       1SG 243
ATOM    243  CA  GLN    30      -0.946  -4.683   3.743  1.00 82.61       1SG 244
ATOM    244  CB  GLN    30      -0.916  -3.394   4.576  1.00 82.61       1SG 245
ATOM    245  CG  GLN    30       0.482  -2.896   4.928  1.00 82.61       1SG 246
ATOM    246  CD  GLN    30       0.316  -1.622   5.745  1.00 82.61       1SG 247
ATOM    247  OE1 GLN    30      -0.436  -1.588   6.715  1.00 82.61       1SG 248
ATOM    248  NE2 GLN    30       1.032  -0.541   5.336  1.00 82.61       1SG 249
ATOM    249  C   GLN    30      -2.392  -4.997   3.549  1.00 82.61       1SG 250
ATOM    250  O   GLN    30      -2.957  -5.834   4.255  1.00 82.61       1SG 251
ATOM    251  N   LEU    31      -3.029  -4.314   2.578  1.00 44.56       1SG 252
ATOM    252  CA  LEU    31      -4.427  -4.486   2.305  1.00 44.56       1SG 253
ATOM    253  CB  LEU    31      -4.924  -3.560   1.179  1.00 44.56       1SG 254
ATOM    254  CG  LEU    31      -4.909  -2.065   1.555  1.00 44.56       1SG 255
ATOM    255  CD1 LEU    31      -5.415  -1.190   0.398  1.00 44.56       1SG 256
ATOM    256  CD2 LEU    31      -5.696  -1.806   2.853  1.00 44.56       1SG 257
ATOM    257  C   LEU    31      -4.648  -5.897   1.867  1.00 44.56       1SG 258
ATOM    258  O   LEU    31      -5.629  -6.528   2.250  1.00 44.56       1SG 259
ATOM    259  N   ALA    32      -3.717  -6.430   1.056  1.00 34.60       1SG 260
ATOM    260  CA  ALA    32      -3.826  -7.768   0.554  1.00 34.60       1SG 261
ATOM    261  CB  ALA    32      -2.652  -8.160  -0.362  1.00 34.60       1SG 262
ATOM    262  C   ALA    32      -3.830  -8.699   1.719  1.00 34.60       1SG 263
ATOM    263  O   ALA    32      -4.554  -9.689   1.722  1.00 34.60       1SG 264
ATOM    264  N   ARG    33      -3.008  -8.401   2.741  1.00138.62       1SG 265
ATOM    265  CA  ARG    33      -2.912  -9.221   3.914  1.00138.62       1SG 266
ATOM    266  CB  ARG    33      -1.782  -8.774   4.853  1.00138.62       1SG 267
ATOM    267  CG  ARG    33      -0.405  -9.029   4.240  1.00138.62       1SG 268
ATOM    268  CD  ARG    33       0.069 -10.473   4.424  1.00138.62       1SG 269
ATOM    269  NE  ARG    33      -0.985 -11.373   3.873  1.00138.62       1SG 270
ATOM    270  CZ  ARG    33      -0.669 -12.654   3.521  1.00138.62       1SG 271
ATOM    271  NH1 ARG    33       0.615 -13.094   3.652  1.00138.62       1SG 272
ATOM    272  NH2 ARG    33      -1.631 -13.493   3.037  1.00138.62       1SG 273
ATOM    273  C   ARG    33      -4.204  -9.189   4.662  1.00138.62       1SG 274
ATOM    274  O   ARG    33      -4.597 -10.188   5.265  1.00138.62       1SG 275
ATOM    275  N   GLN    34      -4.900  -8.035   4.662  1.00 88.64       1SG 276
ATOM    276  CA  GLN    34      -6.133  -7.991   5.391  1.00 88.64       1SG 277
ATOM    277  CB  GLN    34      -6.861  -6.637   5.303  1.00 88.64       1SG 278
ATOM    278  CG  GLN    34      -6.136  -5.477   5.988  1.00 88.64       1SG 279
ATOM    279  CD  GLN    34      -7.017  -4.246   5.828  1.00 88.64       1SG 280
ATOM    280  OE1 GLN    34      -6.605  -3.230   5.272  1.00 88.64       1SG 281
ATOM    281  NE2 GLN    34      -8.276  -4.341   6.330  1.00 88.64       1SG 282
ATOM    282  C   GLN    34      -7.028  -9.018   4.772  1.00 88.64       1SG 283
ATOM    283  O   GLN    34      -7.707  -9.773   5.465  1.00 88.64       1SG 284
ATOM    284  N   ALA    35      -7.029  -9.050   3.428  1.00 53.08       1SG 285
ATOM    285  CA  ALA    35      -7.758  -9.969   2.603  1.00 53.08       1SG 286
ATOM    286  CB  ALA    35      -7.664  -9.627   1.106  1.00 53.08       1SG 287
ATOM    287  C   ALA    35      -7.196 -11.345   2.795  1.00 53.08       1SG 288
ATOM    288  O   ALA    35      -7.912 -12.335   2.657  1.00 53.08       1SG 289
ATOM    289  N   GLU    36      -5.892 -11.437   3.123  1.00140.57       1SG 290
ATOM    290  CA  GLU    36      -5.188 -12.683   3.223  1.00140.57       1SG 291
ATOM    291  CB  GLU    36      -5.888 -13.695   4.148  1.00140.57       1SG 292
ATOM    292  CG  GLU    36      -5.079 -14.969   4.392  1.00140.57       1SG 293
ATOM    293  CD  GLU    36      -3.931 -14.641   5.338  1.00140.57       1SG 294
ATOM    294  OE1 GLU    36      -3.762 -13.440   5.680  1.00140.57       1SG 295
ATOM    295  OE2 GLU    36      -3.204 -15.593   5.731  1.00140.57       1SG 296
ATOM    296  C   GLU    36      -5.059 -13.275   1.854  1.00140.57       1SG 297
ATOM    297  O   GLU    36      -5.173 -14.486   1.669  1.00140.57       1SG 298
ATOM    298  N   GLN    37      -4.802 -12.407   0.850  1.00 60.67       1SG 299
ATOM    299  CA  GLN    37      -4.630 -12.843  -0.505  1.00 60.67       1SG 300
ATOM    300  CB  GLN    37      -5.546 -12.108  -1.494  1.00 60.67       1SG 301
ATOM    301  CG  GLN    37      -5.233 -10.617  -1.586  1.00 60.67       1SG 302
ATOM    302  CD  GLN    37      -6.356  -9.949  -2.358  1.00 60.67       1SG 303
ATOM    303  OE1 GLN    37      -6.882  -8.926  -1.925  1.00 60.67       1SG 304
ATOM    304  NE2 GLN    37      -6.736 -10.535  -3.524  1.00 60.67       1SG 305
ATOM    305  C   GLN    37      -3.212 -12.576  -0.910  1.00 60.67       1SG 306
ATOM    306  O   GLN    37      -2.612 -11.569  -0.540  1.00 60.67       1SG 307
ATOM    307  N   ASP    38      -2.635 -13.535  -1.655  1.00 61.46       1SG 308
ATOM    308  CA  ASP    38      -1.292 -13.495  -2.155  1.00 61.46       1SG 309
ATOM    309  CB  ASP    38      -0.834 -14.858  -2.686  1.00 61.46       1SG 310
ATOM    310  CG  ASP    38      -0.719 -15.778  -1.482  1.00 61.46       1SG 311
ATOM    311  OD1 ASP    38       0.005 -15.402  -0.522  1.00 61.46       1SG 312
ATOM    312  OD2 ASP    38      -1.351 -16.867  -1.507  1.00 61.46       1SG 313
ATOM    313  C   ASP    38      -1.159 -12.513  -3.276  1.00 61.46       1SG 314
ATOM    314  O   ASP    38      -0.095 -11.922  -3.458  1.00 61.46       1SG 315
ATOM    315  N   ILE    39      -2.221 -12.328  -4.087  1.00176.83       1SG 316
ATOM    316  CA  ILE    39      -2.060 -11.462  -5.220  1.00176.83       1SG 317
ATOM    317  CB  ILE    39      -2.447 -12.052  -6.549  1.00176.83       1SG 318
ATOM    318  CG2 ILE    39      -1.431 -13.140  -6.913  1.00176.83       1SG 319
ATOM    319  CG1 ILE    39      -3.909 -12.514  -6.558  1.00176.83       1SG 320
ATOM    320  CD1 ILE    39      -4.195 -13.669  -5.601  1.00176.83       1SG 321
ATOM    321  C   ILE    39      -2.838 -10.203  -5.042  1.00176.83       1SG 322
ATOM    322  O   ILE    39      -3.984 -10.204  -4.596  1.00176.83       1SG 323
ATOM    323  N   VAL    40      -2.192  -9.076  -5.395  1.00118.10       1SG 324
ATOM    324  CA  VAL    40      -2.791  -7.783  -5.258  1.00118.10       1SG 325
ATOM    325  CB  VAL    40      -1.799  -6.707  -4.919  1.00118.10       1SG 326
ATOM    326  CG1 VAL    40      -1.235  -6.985  -3.518  1.00118.10       1SG 327
ATOM    327  CG2 VAL    40      -0.715  -6.683  -6.012  1.00118.10       1SG 328
ATOM    328  C   VAL    40      -3.420  -7.408  -6.559  1.00118.10       1SG 329
ATOM    329  O   VAL    40      -2.851  -7.618  -7.631  1.00118.10       1SG 330
ATOM    330  N   THR    41      -4.650  -6.863  -6.482  1.00 59.19       1SG 331
ATOM    331  CA  THR    41      -5.354  -6.434  -7.655  1.00 59.19       1SG 332
ATOM    332  CB  THR    41      -6.811  -6.817  -7.629  1.00 59.19       1SG 333
ATOM    333  OG1 THR    41      -7.474  -6.225  -6.524  1.00 59.19       1SG 334
ATOM    334  CG2 THR    41      -6.913  -8.347  -7.548  1.00 59.19       1SG 335
ATOM    335  C   THR    41      -5.235  -4.939  -7.743  1.00 59.19       1SG 336
ATOM    336  O   THR    41      -4.828  -4.290  -6.781  1.00 59.19       1SG 337
ATOM    337  N   PRO    42      -5.552  -4.374  -8.887  1.00 75.20       1SG 338
ATOM    338  CA  PRO    42      -5.509  -2.953  -9.109  1.00 75.20       1SG 339
ATOM    339  CD  PRO    42      -6.121  -5.095 -10.014  1.00 75.20       1SG 340
ATOM    340  CB  PRO    42      -5.920  -2.744 -10.566  1.00 75.20       1SG 341
ATOM    341  CG  PRO    42      -6.746  -4.000 -10.897  1.00 75.20       1SG 342
ATOM    342  C   PRO    42      -6.457  -2.289  -8.168  1.00 75.20       1SG 343
ATOM    343  O   PRO    42      -6.309  -1.093  -7.920  1.00 75.20       1SG 344
ATOM    344  N   GLU    43      -7.456  -3.037  -7.668  1.00 42.78       1SG 345
ATOM    345  CA  GLU    43      -8.434  -2.482  -6.781  1.00 42.78       1SG 346
ATOM    346  CB  GLU    43      -9.504  -3.505  -6.368  1.00 42.78       1SG 347
ATOM    347  CG  GLU    43     -10.344  -4.046  -7.526  1.00 42.78       1SG 348
ATOM    348  CD  GLU    43     -11.195  -5.178  -6.968  1.00 42.78       1SG 349
ATOM    349  OE1 GLU    43     -12.186  -4.875  -6.254  1.00 42.78       1SG 350
ATOM    350  OE2 GLU    43     -10.854  -6.362  -7.237  1.00 42.78       1SG 351
ATOM    351  C   GLU    43      -7.742  -2.073  -5.523  1.00 42.78       1SG 352
ATOM    352  O   GLU    43      -8.021  -1.007  -4.974  1.00 42.78       1SG 353
ATOM    353  N   LEU    44      -6.827  -2.928  -5.025  1.00 99.69       1SG 354
ATOM    354  CA  LEU    44      -6.137  -2.619  -3.806  1.00 99.69       1SG 355
ATOM    355  CB  LEU    44      -5.201  -3.721  -3.271  1.00 99.69       1SG 356
ATOM    356  CG  LEU    44      -5.871  -5.049  -2.864  1.00 99.69       1SG 357
ATOM    357  CD1 LEU    44      -7.052  -4.828  -1.909  1.00 99.69       1SG 358
ATOM    358  CD2 LEU    44      -6.206  -5.923  -4.071  1.00 99.69       1SG 359
ATOM    359  C   LEU    44      -5.261  -1.435  -4.037  1.00 99.69       1SG 360
ATOM    360  O   LEU    44      -5.149  -0.557  -3.183  1.00 99.69       1SG 361
ATOM    361  N   VAL    45      -4.608  -1.388  -5.211  1.00 37.38       1SG 362
ATOM    362  CA  VAL    45      -3.689  -0.328  -5.503  1.00 37.38       1SG 363
ATOM    363  CB  VAL    45      -3.007  -0.493  -6.829  1.00 37.38       1SG 364
ATOM    364  CG1 VAL    45      -2.070   0.708  -7.048  1.00 37.38       1SG 365
ATOM    365  CG2 VAL    45      -2.295  -1.856  -6.847  1.00 37.38       1SG 366
ATOM    366  C   VAL    45      -4.440   0.959  -5.525  1.00 37.38       1SG 367
ATOM    367  O   VAL    45      -3.957   1.976  -5.029  1.00 37.38       1SG 368
ATOM    368  N   GLU    46      -5.652   0.948  -6.105  1.00114.73       1SG 369
ATOM    369  CA  GLU    46      -6.437   2.145  -6.191  1.00114.73       1SG 370
ATOM    370  CB  GLU    46      -7.764   1.952  -6.948  1.00114.73       1SG 371
ATOM    371  CG  GLU    46      -7.597   1.692  -8.446  1.00114.73       1SG 372
ATOM    372  CD  GLU    46      -7.255   3.010  -9.126  1.00114.73       1SG 373
ATOM    373  OE1 GLU    46      -6.998   4.009  -8.402  1.00114.73       1SG 374
ATOM    374  OE2 GLU    46      -7.250   3.032 -10.385  1.00114.73       1SG 375
ATOM    375  C   GLU    46      -6.786   2.589  -4.809  1.00114.73       1SG 376
ATOM    376  O   GLU    46      -6.730   3.777  -4.499  1.00114.73       1SG 377
ATOM    377  N   GLN    47      -7.118   1.634  -3.922  1.00117.23       1SG 378
ATOM    378  CA  GLN    47      -7.574   2.002  -2.616  1.00117.23       1SG 379
ATOM    379  CB  GLN    47      -7.906   0.789  -1.733  1.00117.23       1SG 380
ATOM    380  CG  GLN    47      -8.406   1.168  -0.338  1.00117.23       1SG 381
ATOM    381  CD  GLN    47      -9.799   1.779  -0.471  1.00117.23       1SG 382
ATOM    382  OE1 GLN    47     -10.804   1.115  -0.223  1.00117.23       1SG 383
ATOM    383  NE2 GLN    47      -9.863   3.079  -0.868  1.00117.23       1SG 384
ATOM    384  C   GLN    47      -6.501   2.788  -1.933  1.00117.23       1SG 385
ATOM    385  O   GLN    47      -6.777   3.822  -1.328  1.00117.23       1SG 386
ATOM    386  N   ALA    48      -5.238   2.337  -2.033  1.00 30.20       1SG 387
ATOM    387  CA  ALA    48      -4.169   3.030  -1.378  1.00 30.20       1SG 388
ATOM    388  CB  ALA    48      -2.812   2.322  -1.537  1.00 30.20       1SG 389
ATOM    389  C   ALA    48      -4.040   4.397  -1.969  1.00 30.20       1SG 390
ATOM    390  O   ALA    48      -3.817   5.369  -1.250  1.00 30.20       1SG 391
ATOM    391  N   ARG    49      -4.161   4.507  -3.305  1.00125.68       1SG 392
ATOM    392  CA  ARG    49      -3.994   5.781  -3.941  1.00125.68       1SG 393
ATOM    393  CB  ARG    49      -3.991   5.676  -5.477  1.00125.68       1SG 394
ATOM    394  CG  ARG    49      -3.573   6.969  -6.176  1.00125.68       1SG 395
ATOM    395  CD  ARG    49      -3.470   6.833  -7.696  1.00125.68       1SG 396
ATOM    396  NE  ARG    49      -4.826   6.491  -8.211  1.00125.68       1SG 397
ATOM    397  CZ  ARG    49      -5.210   6.904  -9.455  1.00125.68       1SG 398
ATOM    398  NH1 ARG    49      -4.372   7.672 -10.211  1.00125.68       1SG 399
ATOM    399  NH2 ARG    49      -6.432   6.545  -9.945  1.00125.68       1SG 400
ATOM    400  C   ARG    49      -5.090   6.712  -3.515  1.00125.68       1SG 401
ATOM    401  O   ARG    49      -4.844   7.876  -3.201  1.00125.68       1SG 402
ATOM    402  N   LEU    50      -6.339   6.214  -3.482  1.00145.30       1SG 403
ATOM    403  CA  LEU    50      -7.462   7.036  -3.119  1.00145.30       1SG 404
ATOM    404  CB  LEU    50      -8.831   6.355  -3.310  1.00145.30       1SG 405
ATOM    405  CG  LEU    50      -9.324   6.336  -4.771  1.00145.30       1SG 406
ATOM    406  CD1 LEU    50      -9.642   7.761  -5.250  1.00145.30       1SG 407
ATOM    407  CD2 LEU    50      -8.352   5.615  -5.713  1.00145.30       1SG 408
ATOM    408  C   LEU    50      -7.366   7.480  -1.698  1.00145.30       1SG 409
ATOM    409  O   LEU    50      -7.643   8.638  -1.390  1.00145.30       1SG 410
ATOM    410  N   GLU    51      -6.947   6.585  -0.788  1.00 39.69       1SG 411
ATOM    411  CA  GLU    51      -6.933   6.950   0.598  1.00 39.69       1SG 412
ATOM    412  CB  GLU    51      -6.475   5.800   1.512  1.00 39.69       1SG 413
ATOM    413  CG  GLU    51      -5.062   5.307   1.203  1.00 39.69       1SG 414
ATOM    414  CD  GLU    51      -4.774   4.123   2.113  1.00 39.69       1SG 415
ATOM    415  OE1 GLU    51      -5.621   3.835   3.000  1.00 39.69       1SG 416
ATOM    416  OE2 GLU    51      -3.704   3.486   1.929  1.00 39.69       1SG 417
ATOM    417  C   GLU    51      -6.006   8.111   0.784  1.00 39.69       1SG 418
ATOM    418  O   GLU    51      -6.326   9.055   1.506  1.00 39.69       1SG 419
ATOM    419  N   PHE    52      -4.829   8.087   0.134  1.00 47.01       1SG 420
ATOM    420  CA  PHE    52      -3.914   9.179   0.299  1.00 47.01       1SG 421
ATOM    421  CB  PHE    52      -2.540   8.944  -0.356  1.00 47.01       1SG 422
ATOM    422  CG  PHE    52      -1.835   7.900   0.442  1.00 47.01       1SG 423
ATOM    423  CD1 PHE    52      -1.344   8.196   1.695  1.00 47.01       1SG 424
ATOM    424  CD2 PHE    52      -1.645   6.635  -0.066  1.00 47.01       1SG 425
ATOM    425  CE1 PHE    52      -0.688   7.240   2.436  1.00 47.01       1SG 426
ATOM    426  CE2 PHE    52      -0.990   5.677   0.670  1.00 47.01       1SG 427
ATOM    427  CZ  PHE    52      -0.511   5.977   1.922  1.00 47.01       1SG 428
ATOM    428  C   PHE    52      -4.506  10.425  -0.284  1.00 47.01       1SG 429
ATOM    429  O   PHE    52      -4.423  11.494   0.316  1.00 47.01       1SG 430
ATOM    430  N   GLY    53      -5.127  10.322  -1.473  1.00 17.85       1SG 431
ATOM    431  CA  GLY    53      -5.650  11.493  -2.118  1.00 17.85       1SG 432
ATOM    432  C   GLY    53      -6.720  12.103  -1.282  1.00 17.85       1SG 433
ATOM    433  O   GLY    53      -6.766  13.320  -1.113  1.00 17.85       1SG 434
ATOM    434  N   GLN    54      -7.618  11.267  -0.737  1.00 72.74       1SG 435
ATOM    435  CA  GLN    54      -8.704  11.792   0.029  1.00 72.74       1SG 436
ATOM    436  CB  GLN    54     -10.025  11.065  -0.278  1.00 72.74       1SG 437
ATOM    437  CG  GLN    54      -9.978   9.566   0.016  1.00 72.74       1SG 438
ATOM    438  CD  GLN    54     -11.201   8.930  -0.622  1.00 72.74       1SG 439
ATOM    439  OE1 GLN    54     -12.293   9.494  -0.611  1.00 72.74       1SG 440
ATOM    440  NE2 GLN    54     -11.008   7.724  -1.220  1.00 72.74       1SG 441
ATOM    441  C   GLN    54      -8.383  11.652   1.512  1.00 72.74       1SG 442
ATOM    442  O   GLN    54      -8.364  10.503   2.024  1.00 72.74       1SG 443
ATOM    443  OXT GLN    54      -8.157  12.707   2.161  1.00 72.74       1SG 444
TER
END

-----------------------------------------------------------------------------------------
References:

1. Z. Wang, J. Eickholt, and J. Cheng. MULTICOM: A Multi-Level Combination Approach to Protein Structure Prediction and its Assessment in CASP8. Bioinformatics. 26(7):882-888, 2010.

2. J. Cheng. A Multi-Template Combination Algorithm for Protein Comparative Modeling. BMC Structural Biology.8:18, 2008.

     
 
National Institutes of Health (NIH) National Institute of General Medical Sciences (NIGMS) University of Missouri
This page last updated March 16, 2011
Bioinformatics and Systems Biology Laboratory, Department of Computer Science, University of Missouri